| Navigasjon: Hovedside / Institutter / Husdyr- og akvakulturvitenskap |
[Sidekart] [Kontakt] 
|
| Tekststørrelse. |
Lakselus - Konsortie avtale til NFR 200551/S40
Ane Gro Siri SkjelfjordNFR-prosjekt styrt av prosjektleder Thomas Moen hos Aqua Gen
Prosjektleder hos IHA: Sigbjørn Lien
Prosjektet skal legge grunnlaget for systematisk implementering av markør-assistert seleksjon (MAS) og genomisk seleksjon i Aqua Gen sitt avlsarbeide. Aqua Gen har fra før hatt stor suksess med implementering av en QTL (quantitiative trait locus) for resistens mot virussykdommen IPN. Vi ønsker nå å videreføre dette arbeidet ved å ta i bruk MAS på flere egenskaper som allerede er i avlsmålet, samt på en ny og viktig egenskap (lakselus). Vi ønsker også å legge grunnlaget for implementering av genomisk seleksjon, en videreføring av MAS, for de samme egenskapene.
Stamfisk fra Aqua Gen sin avlskjerne, årsklasse 1994-2008, vil bli genotypet på en SNP-chip nylig utviklet av CIGENE (7000 polymorfe SNPer). Genotypene vil bli kombinert med fenotyper, registrert på stamfisken selv eller på avkomsgrupper. Både en tilnærming basert på koblingsulikevekt (assosiasjonsstudie) og en basert på genetisk kobling vil bli brukt. Dette vil kunne avdekke QTL for tilvekst, tidlig kjønnsmodning, filetfarge, fettprosent, utnyttelse av vegetabilsk fôr, resistens mot ILA, IPN, furunkulose, piscirickettsiose, HSMB, samt mange andre egenskaper. I tillegg vil vi gjennomføre en smittetest for resistens mot lakselus. Registreringer fra denne testen vil bli kombinert med genotyper hos foreldre, som skissert over. Identifiserte QTL for lakselus vil deretter bli bekreftet/finkartlagt ved genotyping av dyr fra smittetesten. Vi vil også forsøke å avdekke gener som påvirker lakselusresistens ved resekvensering av dyr med dedusert QTL-genotype (utkast til helgenomsekvens på laksen skal være ferdig i 2010). Datasettet som genereres vil også egne seg godt for å beregne markøreffekter til bruk i genomisk seleksjon.
Vi vil også optimalisere metodikk og infrastruktur med tanke på kostnadseffektiv utnyttelse av MAS og genomisk seleksjon i Aqua Gen, samt ta resultatbaserte beslutninger med tanke på valg av metodikk.
Oppdatert: 08.05.12
Utskriftsvennlig versjon
Del med en venn:
Institutt for husdyr- og akvakulturvitenskap