Øyvind Busk er månedens stipendiat i mars 2008. Han tilhører den bioorganiske forskningsgruppen ved IKBM, og skal i sin doktorgrad se på hvordan fettsyrer påvirker kroppens eget forsvar mot kreft.
Mitt navn er Øyvind Busk og jeg har jobbet som stipendiat på UMB siden august 2008. Jeg er utdannet bioingeniør fra Høyskolen i Østfold, og valgte å fortsette utdannelsen min med en mastergrad her ved UMB. Masteroppgaven skrev jeg på PEP-gruppen ved IKBM, under ledelse av professor Vincent Eijsink.
Proteomikk gav mersmak I løpet av arbeidet med masteren jobbet jeg med molekylærbiologi og biokjemi, og da spesielt med det feltet som kalles proteomikk. Jeg så på overflateproteiner på en meget viktig bakterie som ofte finnes i forbindelse med det som kalles sykehusinfeksjoner. Arbeidet med proteiner ga mersmak, så da det ble en ledig stipendiatstilling innen dette området, nølte jeg ikke med å søke.
Studerer fettsyrers innvirkning på forsvar mot kreft Arbeidet mitt utføres på IKBM, under ledelse av Morten Sørlie. Jeg jobber i min doktorgradsoppgave med fettsyrers innvirkning på vårt eget forsvar mot kreft. Fettsyrer i mat eller kosttilskudd oksideres av enzymsystemer i kroppen og danner fettsyremetabolitter som igjen er agonister (ligander) til transkripsjonsfaktorer, og aktiverer disse ved binding.
Jeg jobber hovedsakelig med en transkripsjonsfaktor som kalles PPAR-gamma (peroxisome proliferator activated receptor gamma). Aktivering av PPAR-gamma fører til produksjon av spesifikke genprodukter, i form av proteiner, som blant annet inkluderer flere syklinavhengig kinase inhibitorer som f.eks. P18, P21 og P27.
Proteiner fører til redusert celledeling Disse proteinene inhiberer syklinavhengige kinaser, og fører dermed til redusert celledeling, hvilket er gunstig ved bekjemping av kreft. PPAR-gamma påvirker også cellenes evne til programmert celledød (apoptose), som er en annen viktig mekanisme ved bekjempelse av kreft, og påvirkes bl.a. ved en oppregulering av proapoptose proteinene BAX og BAD. Disse og andre årsaker gjør at bruk av fettsyrer representerer en ny og lovende terapeutisk tilnærming for visse ondartede menneskelige sykdommer.
Skal etablere kvantitative metoder Vi jobber med å aktivere PPAR-gamma reseptoren i kolon kreftcellelinjer med ulike fettsyremetabolitter for å øke uttrykket av proteiner som er gunstige ved bekjempelse av kreft.
Min jobb er først og fremst å etablere kvantitative metoder for å kunne følge utrykket av proteiner som reduserer celledeling og øker programmert celledød. For å gjøre dette vil jeg benytte meg av først og fremst to strategier:
1. Kvantifisering av signalpeptider ved hjelp av interne standarder 2. SILAC (Stable Isotope Labeling by Amino Acids in Cell Cultures), hvor man isotopmerker prøvene slik at man ved hjelp av massespektrometri kan kartlegge relativ opp- eller nedregulering i hele proteomet.
Når metodene er etablert vil disse bli brukt til å teste virkningen av forskjellige fettsyrederivat.
