Førsteamanuensis Hans Ekkehard Plesser fra IMT oppholder seg denne våren i tre måneder ved RIKEN Brain Science Institute utenfor Tokio. Med over 400 forskere er BSI blant de største hjerneforskningsinstitutt i verden.
Hans Ekkehard Plesser
Foto: Kjersti Sørlie Rimer
Plessers besøk er et ledd i IMTs samarbeid med forskergruppene til dr. Sonja Grün og dr. Markus Diesmann ved BSI. Plesser har hatt tett samarbeid med Diesmann i flere år med fokus på utvikling av simulasjonsverktøyet NEST, som benyttes til simulering av store modeller av hjernen. Dette samarbeidet har allerede ført til flere publikasjoner i internasjonale tidsskrifter og prestisjetunge konferanser i informatikk.
Forskergruppen i beregningsorientert biologi ved UMB arbeider også tett sammen med Grün og Diesmann som del av prosjektet "eNeuro". Her fokuseres det på modellering og dataanalyse av hjerneaktivitet.
Hovedmålet med Plessers besøk er å skrive en bok om de informatiske sidene ved simulering av nevrale nettverk. I faglitteraturen finnes mange gode publikasjoner om modellene av hjernen som undersøkes, men lite om hvordan man faktisk implementerer disse modellene i dataprogrammer, forteller Plesser. Forskere rundt i verden starter derfor ofte på bar bakke, og ”finner opp hjulet på nytt” når de skal simulere sine modeller. I boken vil Plesser og hans samarbeidspartnere samle det som finnes av kunnskap om feltet, for å gjøre det enklere for forskere å finne frem til gode måter å simulere nettverk på.
Kirsebærgren, Tokio i mars
Foto: Hans E Plesser
Til sammen har Abigail Morrison, Marc-Oliver Gewaltig, Markus Diesmann og Hans E Plesser over 20 års erfaring med utvikling av programvare til simulering av store nevrale nettverk. Denne erfaringen skal samles i boken.
Plesser setter stor pris på å kunne konsentrere seg helt om arbeidet med boken. Når man kan tenke lenge og konsentrert om en oppgave, blir det enklere å se sammenhenger og man får inspirasjon og ideer til nye artikler, legger han til.
Oppholdet har vært så stimulerende at Plesser og Diesmann, i tillegg til å skrive bok, har skrevet en fagartikkel i løpet av få uker. Nå jobber han sammen med Sonja Grün om en annen idé som han har hatt lenge. Dessuten er det meget spennende og lærerikt å se hvordan andre arbeider, hva slags gruppemøter de har, hvordan veiledes medarbeiderne, hvilke dataverktøy benyttes osv. Plesser gleder seg til å ta med alle erfaringer og ideer hjem.
Oppholdet ved RIKEN har et personlig tilsnitt for Plesser. Han traff sin norske kone ved RIKEN midt på 90-tallet. Hadde jeg ikke valgt ett års opphold ved RIKEN før jeg begynte med doktorgradsstudiene mine, hadde jeg hverken kommet til å arbeide med beregningsorientert nevrovitenskap eller flyttet til Norge, forteller han.
Tokio er en fascinerende by å være i, spesielt nå da kirsebærtrærne blomstrer. Plesser er meget takknemmelig for den finansielle støtten han har fått fra den norske noden til den International Neuroinformatics Coordinating Facility og fra UMB, som har gjort dette oppholdet mulig.
