Planteforsk Plantevernet og Institutt for Plantefag
Onsdag den 7. mai forsvarte M. Sc. Jihong Liu Clarke sin avhandling ”Molecular study of chitinolytic enzyme encoding genes in Trichoderma atroviridestrain P1 using real-time RT-PCR and the utilization of the genes in transgenic barley” (Molekylære studier av gener som koder for kitinolytiske enzymer i Trichoderma atroviride P1 ved bruk av kvantitativ real-time RT-PCR, og utnyttelsen av disse genene i transgen bygg).
Hun foreleste over emnet ” Potentials and weaknesses in transferring novel transgenic resistance traits to our crops” og deretter orienterte som sitt vitenskapelige arbeid.
Veiledere: Veiledere for doktorgradsstudiet har vært: Professor Leif Sundheim med forskningsleder Sonja Klemsdal, Planteforsk Plantevernet og professor Arne Tronsmo, IKB som assisterende veiledere.
Sensurkomite: Sensurkomitéen som har vurdert avhandlingen, er: Professor Tomas Bryngelsson, Institutionen för växtvetenskap, Sveriges lantbruksuniversitet, Alnarp, Sverige, Forskningsdirektør Dr. Anders Lønneborg, Diagenic AS, Østensjøveien 15B, Oslo og Førsteamaniuensis Anne Kjersti Uhlen, Institutt for plantefag, NLH.
Jihong Liu Clarke M. Sc. Jihong Liu Clarke har hovedfag fra Sichuan Agricultural University i Kina 1986 og lisensiatgrad i Plantebioteknologi fra Sveriges lantbruksuniversitet i 1995. Fra 1997 har hun vært stipendiat og forsker ved Planteforsk Plantevernet i Ås. Jihong Clarke er født og oppvokst i Kina, men er nå bosatt i Moss.
Litt om temaet: Jihong Liu Clarke i Bioteknologigruppen ved Planteforsk Plantevernet på Ås har studert den jordboende soppen Trichoderma atroviride. Den kan hemme vekst av sykdomsfremkallende sopper på planter. Clarke og hennes kolleger har undersøkt de molekylære mekanismer som ligger til grunn for effekten av T. atroviride i biologisk bekjempelse av plantesykdommer.
T. atroviride har evne til å produsere kitinolyttiske enzymer (kitinaser), som ødelegger polysaccharidet kitin, en svært viktig byggesten i celleveggen hos sopp. Clarke har isolert og karakterisert gener som koder for kitinaser. Hun har isolert et nytt endokitinasegen, ech 30. Dette og de to andre kitinasegenene ech42 og nag1, er studert med bioteknologiske metoder.
Clarke har vist at de tre genene reguleres ved en interaksjon mellom nitrogen, glukose og kitin. Den høyeste og tidligste ekspresjonen ble funnet ved mangel på glukose og nitrogen i vekstmediet. Høy konsentrasjon reduserer uttrykket av alle tre genene. Det ble funnet en sterk negativ forbindelse mellom kitin og ech30 ekspresjon, og positiv forbindelse mellom kitin og genene ech42 og nag1. Når T. atroviride dyrkes sammen med ulike sopper, tyder resultatene på at også ech30, tilsvarende det som er kjent for ech42 og nag1, er involvert i den innvirkning T. atroviride har på sykdomsfremkallende sopper.
Byggplanter er ved gentransformasjon forsøkt laget resistente mot den mykotoksinproduserende soppen Fusarium. Et gen som koder for kitinase er satt under regulering av et element fra bygg, som sikrer at genet kun uttrykkes i frøets aleuronlag de første ukene etter pollinering. Dette er tidsrommet for naturlig smitte av Fusarium i akset. Transformasjonen resulterte i transgene linjer av bygg med soppgenene ech42 eller nag1. Studier av første generasjon av planter viste ustabilt uttrykk av ech42. Etter smitte med Fusarium viste plantene varierende grad av resistens.
Clarke, J. L. 2003. Molecular study of chitinolytic enzyme encoding genes in Trichoderma atroviride strain P1 using real-time RT-PCR and the utilization of the genes in transgenic barley. Agricultural University of Norway, Ås, Norway. Dr Scient. Thesis 2003: 16, ISBN 82-575-0555-2.
